Deus tem utilizado de acontecimentos e circunstâncias ao longo do séculos, vivenciados por pessoas ou grupo de pessoas, levando estes à se converterem ao Senhor Jesus e colocarem-se à disposição para cumprirem a vontade de dEle, que é a busca das almas perdidas. Assim aconteceu com a Igreja Batista Ministério da Reconciliação, onde acontecimentos pessoais vivenciados pelo casal Walter Urbaneja e Geni P. Urbaneja dentre outros irmãos, culminaram com a formação da igreja local.
Em 1985, três anos após a conversão do casal, Walter Urbaneja disse que Geni deveria começar um estudo bíblico em sua própria casa com mulheres vizinhas, as quais já haviam aceitado a Jesus como Senhor e Salvador. Inicialmente, Geni não se sentiu preparada, pois era uma grande responsabilidade.
Mas Deus confirmou isso em seu coração com uma visão que teve após o batismo de seu esposo. Ela viu que embaixo de sua casa, havia um rio que jorrava águas cristalinas, viu também uma fila de pessoas que queriam receber oração, além de outras que chegavam ao local para ver de onde saía tanta água. A princípio ela não entendeu a visão e buscou orientação na Palavra de Deus. Abrindo a Bíblia pôde observar o texto das 10 minas (talentos). Então compreendeu que Deus tinha uma grande obra para ser realizada naquele lugar, ou seja, na sua casa.
O primeiro estudo bíblico aconteceu em 22 de julho de 1985, uma segunda-feira às 14:30, com aproximadamente 20 pessoas, duas conversões e três curas. Alguns anos mais tarde em 19 de março de 1991, iniciaram-se os cultos de terça-feira às 20:00 para atender aqueles que trabalhavam durante o dia e não tinham disponibilidade de participar as segunda-feira a tarde.
No final de julho de 1997, iniciaram os cultos aos sábados à noite com um grupo de jovens casais e no dia 05 de outubro de 1997 aconteceu o primeiro culto de domingo com pessoas recém-convertidas e evangelizadas pelo próprio casal, tendo como foco pessoas sem Jesus, missões e trabalho com crianças.
Então, ao primeiro dia do mês de abril de 1999, a Igreja Batista Ministério da Reconciliação deixa de ser apenas a casa de uma família que estava obedecendo a vontade de Deus, cedendo-a para realizar cultos, para se tornar publicamente uma igreja com documentação legal e jurídica. Exatamente no dia 1º de abril, data que para muitos é conhecida como o “dia da mentira”, mas está igreja nasceu nesse dia para proclamar a verdade, que é Jesus Cristo, nosso Senhor e Salvador.
Obs.: Essa é uma versão resumida da história. A versão completa e detalhada resultou no trabalho de conclusão do curso de Bacharel em Teologia da pastora Geni P. Urbaneja, pelo Seminário Teológico Evangélico do Betel Brasileiro.